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Caffeine inheritance in interspecific hybrids of Coffea arabica x Coffea canephora (Gentianales, Rubiaceae)
(Sociedade Brasileira de Genética, 2008) Priolli, Regina H.G.; Mazzafera, Paulo; Siqueira, Walter J.; Möller, Milene; Zucchi, Maria Imaculada; Ramos, Luis Carlos S.; Gallo, Paulo B.; Colombo, Carlos A.
Caffeine inheritance was investigated in F2 and BC1F1 generations between Coffea arabica var. Bourbon Vermelho (BV) and Coffea canephora var. Robusta 4x (R4x). The caffeine content of seeds and leaves was determined during 2004 and 2005. Microsatellite loci-markers were used to deduce the meiotic pattern of chromosome pairing of tetraploid interspecific hybrids. Genetic analysis indicated that caffeine content in seeds was quantitatively inherited and controlled by genes with additive effects. The estimates of broad-sense heritability of caffeine content in seeds were high for both generations. In coffee leaves, the caffeine content (BSH) from the same populations showed transgressive segregants with enhanced levels and high BSH. Segregation of loci-markers in BC1F1 populations showed that the ratios of the gametes genotype did not differ significantly from those expected assuming random associations and tetrasomic inheritance. The results confirm the existence of distinct mechanisms controlling the caffeine content in seeds and leaves, the gene exchange between the C. arabica BV and C. canephora R4x genomes and favorable conditions for improving caffeine content in this coffee population.
CONSTRUÇÃO DE UM MAPA GENÉTICO A PARTIR DE UMA POPULAÇÃO F 2 DERIVADA DO CRUZAMENTO ENTRE Coffea arabica E C. canephora E SUA UTILIDADE PARA QUALIDADE DE BEBIDA
(2009) Priolli, Regina H. G.; Ramos, Luis Carlos S.; Pot, David; Moller, Milene; Gallo, Paulo B.; Pastina, Maria M.; Garcia, Antonio A. F.; Yamamoto, Paula Y.; Lannes, Sérgio D.; Vieira, Luiz G. E.; Ferreira, Lucia P.; Mazzafera, Paulo; Pereira, Luiz Filipe P.; Colombo, Carlos A.; Embrapa - Café
Mapas genéticos com base em marcadores moleculares têm sido desenvolvidos em grande número de plantas como uma estratégia eficaz para seleção assistida pelo marcador. No presente estudo, marcadores AFLP e SSR foram utilizados para construção de um mapa genético em uma população F 2 criada a partir da autofecundação do híbrido F 1 do cruzamento entre Coffea arabica e Coffea canephora. Foram identificados 349 marcadores AFLP e 50 alelos SSR segregantes em 90 plantas F 2. Para construção do mapa, apenas marcas em dose única e segregação 3:1 no F2 foram consideradas (248 marcadores AFLP e SSR 27 alelos, ou 68,9% dos marcadores polimórficos). Cento e sessenta e nove marcadores foram mapeados (155 AFLP e 14 SSR). Trinta e sete grupos ligação correspondentes a um total de 1011 cM foram obtidos, com uma distância média entre as marcas de 5,98 cm e 4,6 marcadores por grupo de ligação. Quarenta e seis marcadores associados a características agronômicas de interesse foram encontrados, dos quais, dezenove foram associados com teor de açúcar, oito de cafeína, oito para CGA, um para a cafeína e CGA e dez para a produção total por planta. A análise baseada em marcadores de dose única permitiu obter informação de QTL putativo associado à qualidade de bebida do café e produtividade. Marcadores adicionais serão incluídos a este trabalho para maior cobertura do genoma café.
Efeito das estações do ano na calogênese e embriogênese somática em oito genótipos de Coffea arabica
(2005) Almeida, Julieta Andrea Silva de; Ramos, Luis Carlos S.; Fazuoli, Luiz Carlos; Embrapa - Café
Estudou-se o efeito das estações do ano na capacidade de embriogênese somática indireta de oito genótipos de Coffea arabica, do germoplasma Icatu, do Instituto Agronômico de Campinas, oriundos do cruzamento entre C. arabica cv Bourbon Vermelho e C. canephora cv Robusta. Avaliaram-se a formação de calo nos explantes, a contaminação, o número de lados do explante com calo, o diâmetro de calo e a formação de embriões. Os resultados foram analisados levando-se em conta os doze meses do ano, as estações de chuva e da seca e as quatro estações do ano, primavera, verão, outono e inverno. A resposta de embriogênese somática variou tanto ao longo dos meses do ano quanto das estações do ano. No entanto, o efeito das estações foi mais determinante para a calogênese do que para a embriogênese. Além disso, a embriogênese somática também esteve sob o controle genético já que variou entre os genótipos.
Efeito das estações do ano na calogênese e embriogênese somática em oito genótipos de Coffea arabica
(2005) Almeida, Julieta Andrea Silva; Carvalho, José Ruy Porto de; Ramos, Luis Carlos S.; Fazuoli, Luiz Carlos; Embrapa - Café
Estudou-se o efeito das estações do ano na capacidade de embriogênese somática indireta de oito genótipos de Coffea arabica, do germoplasma Icatu, do Instituto Agronômico de Campinas, oriundos do cruzamento entre C. arabica cv Bourbon Vermelho e C. canephora cv Robusta. Foram realizadas coletas de folhas de cada genótipo durante dois anos. Avaliaram-se a formação de calo nos explantes, a contaminação, o número de lados do explante com calo, o diâmetro de calo e a formação de embriões. Os resultados foram analisados levando-se em conta os doze meses do ano, as estações de chuva e da seca ou as quatro estações do ano. A resposta de embriogênese somática variou tanto ao longo dos meses do ano quanto das estações do ano. No entanto, o efeito das estações foi mais determinante para a calogênese do que para a embriogênese. Além disso, a embriogênese somática também esteve sob o controle genético já que variou entre os genótipos.
NOVOS MARCADORES PARA FINS DE MAPEAMENTO E LOCALIZAÇÃO DE QTLs A PARTIR DE PCR-RFLP DE GENES DO GENOMA CAFÉ BRASILEIRO
(2009) Colombo, Carlos Augusto; Yamamoto, Paula Yuri; Ramos, Luis Carlos S.; Mazzafera, Paulo; Gallo, Paulo Boller; Vilella, Otávia T.; Lannes, Sérgio D.; Pot, David; Ferreira, Lucia P.; Vieira, Luiz Gonzaga E.; Pereira, Luiz Filipe P.; Embrapa - Café
O mapeamento genético é uma das estratégias mais visadas para fins de melhoramento genético e ganha maior importância a partir do surgimento de marcadores do tipo SNPs ou INDELs, facilitado pelos projetos genomas, sobretudo de ESTs. Assim, análises in silico de busca de polimorfismo SNPs em seqüências relacionadas com qualidade de bebida e derivadas de C.arabica e C.canephora foram analisadas e o polimorfismo entre as duas espécies validado para seis genes (quatro proteases e dois de sacarose) a partir de estudos de laboratório utilizando a técnica PCR-RFLP. Para tanto, após confirmação do polimorfismo nas duas espécies parentais, foram genotipadas 90 plantas F2 derivadas da autofecundação de um híbrido interespecífico de Coffea arabica e C. canephora 4x. Após a obtenção dos amplificados, estes foram digeridos com diversas enzimas de restrição de quatro bases (Alu I, Dde I, Eco RI, Hae III, Mse I e Msp, Fnu DII, Taq I; Scr FI). Dos seis genes analisados, quatro deles apresentaram segregação do tipo 3:1 na população F2 (Cisteína 8, Cisteína 5, β-Fructosidase e Sacarose Fosfato Sintase), demonstrando a utilização dos mesmos para fins de mapeamento.
OBTENÇÃO DE MARCADORES MOLECULARES POR MEIO DE PCR-RFLP DE GENES RELACIONADOS COM QUALIDADE EM CAFÉ
(2009) Villela, Otávia T.; Lannes, Sérgio Dias; Pot, David; Ferreira, Lucia P.; Priolli, Regina Helena G.; Ramos, Luis Carlos S.; Colombo, Carlos Augusto; Vieira, Luiz Gonzaga E.; Pereira, Luiz Filipe P.; Embrapa - Café
A qualidade de bebida do café é fator fundamental para sua comercialização, pois agrega valor ao produto, garantindo maior competitividade e melhores preços no mercado. A composição química do café é um dos fatores que determinam a qualidade da bebida. Seu sabor e seu aroma são resultantes da presença combinada de vários constituintes, dentre os quais os ácidos clorogênicos, os diterpenos e os açúcares. O objetivo deste trabalho foi buscar polimorfismos a partir de PCR-RFLP utilizando primers baseados em sequências ESTs de genes relacionados com a qualidade de bebida. Para isso foi utilizado o DNA de uma população F 2 formada a partir da autofecundação de um híbrido interespecífico de Coffea arabica e C. canephora. Os resultados revelaram um total de doze marcas polimórficas na população. Dentre essas marcas, quatro foram obtidas através da presença e da ausência da amplificação dos genes. Oito combinações polimórficas foram obtidas através da clivagem do produto de PCR por quatro enzimas de restrição (TaqI, BsuRI, RsaI e HhaI). Com a validação dos polimorfismos encontrados nos amplicons, essas marcas estão sendo utilizadas para trabalhos de mapeamento na população de arabustas com objetivo de identificar QTLs relacionados à concentração de compostos como cafeína, ácidos clorogênicos, diterpenos, açúcares, bem como de proteases.