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Item Identificação através de genômica funcional de três genes homeobox envolvidos com a resposta ao estresse hídrico em café a partir de dados do Banco Genoma Café(2007) Cruz, Fernanda P. da; Arongaus, Adriana; Romano, Eduardo; Vaslin, Maïté; Carvalho, Alan de; Ferreira, Marcio Alves; Embrapa - CaféOs fatores de transcrição do tipo homeobox em plantas se encontram freqüentemente envolvidos em processos do desenvolvimento. Eles estão divididos em 8 sub-famílias: Zinc-finger homeobox, Bell, Knox, Wushel-like, HD-Zip-I, -II, -III, e –IV, de acordo com a conservação de seqüência e estrutura, dentro e fora do homeodomínio. Estudos recentes demonstraram que esses fatores estão também relacionados com a regulação da resposta ao estresse em plantas. Análises de expressão dos genes Athb -5,-6, -7, -12 (sub-família HD-ZipI) em Arabidopsis thaliana, e do putativo ortólogo em girassol Hahb-4, sugerem que esses genes podem regular o crescimento em resposta ao hormônio ácido abscísico (ABA) em condições de déficit hídrico, e aumentar a tolerância à seca. Neste trabalho, procuramos identificar dentro do banco de dados gerado pelo Programa “Genoma Café” potenciais genes homeobox utilizado métodos filogenéticos para classificá-los dentro dos grupos já bem estabelecidos. Para eleger os genes mais interessantes, diferencialmente expressos em condições de estresse hídrico, foi realizada uma análise in silico de expressão (Northern digital). A partir destas análises, três contigs foram escolhidos para estudos posteriores, sendo renomeados de acordo com o mais similar em A. thaliana: Cahat22, Cahb12 e Cahb1. Os níveis de expressão desses três genes homeobox foram analisados por PCR em tempo real (qPCR) em plantas de Coffea arabica submetidas à condições de déficit hídrico. Os resultados obtidos confirmaram o observado nas análises de Northern digital, e todos os genes homeobox de café apresentaram seu padrão de expressão modulado pela condição de déficit hídrico em folhas, caules e raízes, sendo este padrão diferente para cada gene. Análises de qPCR em distintas regiões da raiz, e experimentos de hibridização in situ, nos permitiram observar o padrão de expressão em diferentes estágios de desenvolvimento, assim como a expressão espacial dos genes Cahb1 e Cahb12: Cahb12 é preferencialmente expresso em raízes laterais e no início da raiz principal, enquanto Cahb1 possui uma expressão mais uniforme ao longo desse órgão. Os dois genes foram reprimidos na porção mais próxima ao meristema apical da raiz. Os resultados dos experimentos de hibridização in situ revelaram que Cahb1 e Cahb12 são expressos exclusivamente no floema das raízes.