CARACTERIZAÇÃO FUNCIONAL E PERFIL DE EXPRESSÃO IN SILICO DE QUITINASES DO CAFEST

Abstract

O CafEST é a base de dados que armazena as 200 mil ESTs geradas pelo Projeto Brasileiro do Genoma Café. Em trabalho anterior, sequências potencialmente associadas com a defesa do cafeeiro a doenças foram identificadas. Entre essas sequências, genes de quitinases. As proteínas codificadas por esses genes são enzimas que podem desempenhar funções como metabolismo de quitina, mecanismos de defesa contra patógenos e estresse abiótico, nutrição, parasitismo entre outras. Dada a importância desta enzima para a planta, o objetivo do presente trabalho foi analisar as ESTs de quitinase identificadas previamente. Para isso foi realizada uma caracterização funcional das sequências e construído um perfil de expressão in silico. Os resultados mostraram que essas proteínas estão envolvidas em importantes processos biológicos e funções moleculares nas células da planta e estão mais expressas, principalmente, em bibliotecas que apresentam algum componente de estresse.

CafEST is the database that stores the 200,000 ESTs generated by the Brazilian Coffee Genome Project. In previous work, sequences potentially associated with the defense of coffee to diseases were identified. Among these sequences, chitinase genes. The proteins encoded by these genes are enzymes that can perform functions such as chitin metabolism, plant defense mechanisms against pathogens and abiotic stresses, nutrition, parasitism among others. Given the importance of this enzyme to the plant, the objective of this study was to analyze the chitinase ESTs previously identified. To do that, we performed a functional characterization of the sequences and constructed an in silico expression profile. Results showed that these proteins are involved in important biological processes and molecular functions in the plant cell and are expressed mostly in libraries that show some stress component.