Diversidade genética por AFLP de Colletotrichum gloeosporioides e C. kahawae isolados de cafeeiros

Abstract

A diversidade genética entre 33 isolados de Colletotrichum. gloeosporioides oriundos de diferentes lavouras cafeeiras e um isolado (DNA) de C. kahawae, cedido pelo CIFC, Portugal, foi estudada utilizando o marcador AFLP. As três combinações de pares de oligonucleotídeos AFLP geraram 187 bandas polimórficas que foram utilizadas no agrupamento UPGMA. De acordo com o dendrograma, ao nível de 90% de distância genética foram definidos quatro grupos: 1) formado de 15 isolados de Minas Gerais, 2 de São Paulo e 1 do Paraná; 2) um isolado de MG; 3) 10 de MG, 3 do Espírito Santo e um de SP; 4) composto apenas por C. kahawae. Alguns dos isolados de C. gloeosporioides compartilharam alta similaridade entre eles, e outros, apresentaram grande distância genética. Não ocorreu associação de C. gloeosporioides com as regiões geográficas amostradas e as variedades de onde foram isolados. A análise do dendrograma mostrou que C. kahawae (patogênico ao cafeeiro) não agrupou com nenhum dos isolados de C. gloeosporioides, mostrando alta divergência genética (aproximadamente 100%) em relação a eles. O padrão de bandas AFLP mostrou que C. kahawae é geneticamente distinto de C. gloeosporioides.The genetic diversity among 33 isolates of C. gloeosporioides from various Brazilian coffee plantations and one isolate (DNA) of C. kahawae, obtained from CIFC, Portugal, were studied using AFLP marker. The three AFLP primer-pair combinations generated 187 polymorphic bands which were used to construct a dendrogram with the UPGMA method. According to the dendrogram, at 90% level of genetic distance the isolates were clustered into four groups: 1) formed by 15 isolated of Minas Gerais, two from São Paulo and one from Paraná; 2) only one isolated from MG; 3) included 10 isolates from MG, three from Espírito Santo and one from São Paulo; 4) composed only by C. kahawae. Some of the isolates of C. gloeosporioides shared high similarity among themselves, and others, showed large genetic distance. There were no correlation between genetic polymorphism and geographical origin of C. gloeosporioides and their varieties sources. The analysis of the dendrogram showed that C. kahawae (pathogenic to coffee) did not group with any isolates of C. gloeosporioides, revealing to be highly divergent (approximately 100%). The AFLP pattern of the two species showed that C. kahawae is genetically distinct from C. gloeosporioides.