Identificação e caracterização do gene galactinol sintase em Coffea arabica L.

Abstract

Com a finalização do Projeto Genoma Café (http:/ www.lge.ibi.unicamp.br/cafe/), um conjunto de 150.000 seqüências expressas (ESTs) em diversos tecidos, em diferentes etapas de desenvolvimento e também em diversas condições ambientais, estão disponíveis para estudos in silico e in vitro, no qual se espera obter informações quanto ao mecanismo de resposta a estresses abióticos. Visando a caracterização dos genes relacionados ao estresse hídrico do café, através do banco de dados do Genoma Café, o objetivo deste trabalho foi identificar os genes de galactinol sintase. A partir de 91 seqüências foram encontrados 3 contigs (CaGolS1, 2 e 3), dos quais foram desenhados oligonucleotídeos. A expressão dos genes foi analisada através de RT-PCR em diferentes tecidos do cafeeiro (folha, raiz, ramo e botão floral), sob condições de campo. Nas análises somente foram detectados transcritos para o gene CaGolS3. A expressão dos genes CaGolS1 e CaGolS2 não foi observada em tecidos foliar sob condições normais, no entanto, dados de literatura e análise in silico das bibliotecas de cDNA indicam que esses genes são provavelmente expressos em tecidos sob estresse hídrico.

The Coffee Genome Project (www.lge.ibi.unicamp.br/cafe) finished the sequencing of 150.000 expressed sequences tags (ESTs) from several tissues, different stages of development and several environmental conditions. These sequences are available for in silico and in vitro studies, in which we expect to obtain information about the mechanisms of abiotic stress response. The objective of this study was to characterize genes of galactinol synthase, related to the water deficit, through the searching of Coffe Genome Database. Starting from 91 sequences we have found 3 contigs (CaGolS1, 2 and 3), which were used to design oligonucleotides. Gene expression was analyzed through RT-PCR in different tissues of coffee growing at normal field conditions. The CaGolS2 showed transcription activity in leaves, while it was not possible to detect any transcripts from CaGolS1 and CaGolS3. According to the literature as well as the in silico analysis of the Coffee Genome, CaGolS1 and CaGolS3 may be expressed in plant tissues water deficit conditions.