MARCADORES SCARS PARA O GENE DE RESISTÊNCIA A H. vastatrix RAÇA IIb SÃO POSICIONADOS SIMULTANEAMENTE DENTRO DE UM ÚNICO CLONE BAC
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2009
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Resumo
O alto custo e inviabilidade econômica do controle químico da ferrugem alaranjada, uma das doenças que mais causa prejuízos econômicos aos cafeicultores, resulta na procura por uma resistência durável como a melhor alternativa para contornar este sério problema econômico da cafeicultura brasileira. Neste trabalho, avaliamos uma população de 224 genótipos segregantes de um cruzamento entre o Híbrido de Timor com Catuai Amarelo (IAC 30), contendo apenas um gene de resistência a raça II-b de H. vastarix. A partir do mapa genético de marcadores AFLP foi construído um mapa de alta resolução com 6 marcadores SCARs delimitando uma região cromossômica de 9,45 cM e flanqueando bilateralmente o gene de resistência a 0,7 e 0,9 cM. Com os mesmo marcadores identificamos dois clones BAC sobrepostos, contendo ambos os dois marcadores SCARs que flanqueiam o gene, delimitando o mesmo a uma região cromossômica clonada de 130 Kb. Também construímos o contig parcial ordenando 5 clones BAC posicionados por 4 marcadores SCAR com duplos insertos. Estes resultados tornam possível agora, em curto prazo, a clonagem posicional do primeiro gene de resistência do café a ferrugem do cafeeiro.
The high cost of fungicides to control coffee rust, the more important disease of this crop, makes the chemical control non viable economically, being plant resistance the major alternative to solve this important economic problem. In this work, we evaluated a population of 224 segregant genotypes from a cross between a Hibrido de Timor clone, a resistant genotype with a single dominant resistance gene to race II-b, with a susceptible Catuai Amarelo (IAC 30). Starting from the genetic map of AFLP markers, a high resolution map was built with 6 SCARs markers delimiting a chromosomal region of 9,45 cM with flanking markers, far about 0.7 and 0.9 cM of the resistance gene. These two markers were physically mapped to two similar BAC clones, restricting the localization of this gene to an 130 Kg genomic region cloned. We also built the partial contig by ordering 5 BAC clones with the others four SCAR markers. This results make possible now, at short term, the positional cloning of the first coffee resistance gene to coffee leaf rust.
The high cost of fungicides to control coffee rust, the more important disease of this crop, makes the chemical control non viable economically, being plant resistance the major alternative to solve this important economic problem. In this work, we evaluated a population of 224 segregant genotypes from a cross between a Hibrido de Timor clone, a resistant genotype with a single dominant resistance gene to race II-b, with a susceptible Catuai Amarelo (IAC 30). Starting from the genetic map of AFLP markers, a high resolution map was built with 6 SCARs markers delimiting a chromosomal region of 9,45 cM with flanking markers, far about 0.7 and 0.9 cM of the resistance gene. These two markers were physically mapped to two similar BAC clones, restricting the localization of this gene to an 130 Kg genomic region cloned. We also built the partial contig by ordering 5 BAC clones with the others four SCAR markers. This results make possible now, at short term, the positional cloning of the first coffee resistance gene to coffee leaf rust.
Descrição
Trabalho apresentado no Simpósio de Pesquisa dos Cafés do Brasil (6. : 2009 : Vitória, ES). Anais Brasília, D.F: Embrapa - Café, 2011
Palavras-chave
Gene R, mapeamento genético, contig, ferrugem do cafeeiro, R gene, genetic mapping, contig, coffee rust
Citação
Diola, Valdir; Caixeta, Eveline Teixeira; Zambolim, Eunize Maciel; Sakiyama, Ney Sussumu; Pereira, Luiz Felipe Protasio; Loureiro, Marcelo Ehlers. Marcadores scars para o gene de resistência a H vastatrix raça llb são posicionados simultaneamente dentro de um único clone BAC. In: Simpósio de Pesquisa dos cafés do Brasil (6. : 2009 : Vitória, ES). Anais Brasília, D.F: Embrapa - Café, 2011 (1 CD-ROM), 6p.