Transcriptoma de frutos de Coffea arabica L. ao longo do seu desenvolvimento inicial

dc.contributor.authorIvamoto, Suzana Tiemi
dc.contributor.authorReis Junior, Osvaldo
dc.contributor.authorCarazzolle, Marcelo Falsarella
dc.contributor.authorDomingues, Douglas Silva
dc.contributor.authorPereira, Luiz Filipe Protasio
dc.date.accessioned2015-06-24T17:16:49Z
dc.date.available2015-06-24T17:16:49Z
dc.date.issued2013
dc.descriptionTrabalho apresentado no VIII Simpósio de Pesquisa dos Cafés do Brasilpt_BR
dc.description.abstractNeste trabalho foi realizado o seqüenciamento de RNA em larga escala de 12 bibliotecas de Coffea arabica cv. IAPAR59: folha, flor, frutos ao longo do seu desenvolvimento e frutos tratados com o indutor de metabolismo secundário metiljasmonato. Foram gerados no total 84.798.835 sequências (Illumina, HiSeq2000), que foram montadas em 127.600 contigs com tamanho médio de 1264bp, dos quais 65480 foram considerados como variantes de splicing únicos (unigenes). Neste trabalho, reportamos a montagem de novo do transcriptoma realizada com as sequências destas bibliotecas e os dados preliminares de anotação funcional e categorização. Trata-se do primeiro trabalho de sequenciamento Illumina com frutos de cafeeiro, que pode trazer importantes informações sobre genes candidatos relacionados a produção de compostos-chave envolvidos na qualidade do café e maturação de frutos.pt_BR
dc.format5 páginaspt_BR
dc.identifier.citationIVAMOTO, S. T. et al. Transcriptoma de frutos de Coffea arabica L. ao longo do seu desenvolvimento inicial. In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 8., 2013, Salvador. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2013, 5 p.pt_BR
dc.identifier.urihttp://www.sbicafe.ufv.br:80/handle/123456789/3458
dc.language.isopt_BRpt_BR
dc.publisherEmbrapa Cafépt_BR
dc.subjectRNA-Seqpt_BR
dc.subjectTranscriptomapt_BR
dc.subjectCoffea arabicapt_BR
dc.subjectIlluminapt_BR
dc.subject.classificationCafeicultura::Genética e melhoramentopt_BR
dc.titleTranscriptoma de frutos de Coffea arabica L. ao longo do seu desenvolvimento inicialpt_BR
dc.title.alternativeTranscriptomic resources for early-stage fruit development of Coffea arabica L.pt_BR
dc.typeTrabalho de Evento Científicopt_BR

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