Microsatellite markers in analysis of resistance to coffee leaf miner in Arabica coffee

Abstract

The objective of this work was to analyze coffee (Coffea arabica) genotypes resistant to the coffee leaf miner (Leucoptera coffeella) using microsatellite markers. Sixty‐six loci were evaluated, of which 63 were obtained from the Brazilian Coffee Expressed Sequence Tag (EST) database. These loci were amplified in bulks of individuals from F 5 progenies of 'Siriema' (C. arabica x C. racemosa) resistant and susceptible to the insect, in eight samples of C. racemosa, and in a F 6 population of 'Siriema' with 91 individuals segregating for resistance to the leaf miner. Polymorphisms were verified for two simple sequence repeat (SSR) loci in bulks of the susceptible progenies. The two polymorphic alleles were present in around 70% of the susceptible genotypes in F 5 and in approximately 90% of the susceptible individuals in F 6 . However, the polymorphic EST‐SSR markers among populations contrasting for resistance to leaf miner were not correlated to the evaluated characteristics. SSR markers show inter‐ and intraspecific polymorphism in C. arabica and C. racemosa.

O objetivo deste trabalho foi analisar genótipos de cafeeiro (Coffea arabica) resistentes ao bicho‐mineiro (Leucoptera coffeella), com uso de marcadores microssatélites. Foram avaliados 66 locos, dos quais 63 foram obtidos do banco de sequências expressas (EST) de café. Esses locos foram amplificados em “bulks” de progênies F 5 de 'Siriema' (C. arabica x C. racemosa) resistentes e suscetíveis ao ataque da praga, em oito acessos de C. racemosa, e em uma população F 6 de 'Siriema' com 91 indivíduos que segregam para resistência ao bicho‐mineiro. Os polimorfismos foram verificados em dois locos de marcadores microssatélites (SSR), nos “bulks” das progênies suscetíveis. Os dois alelos polimórficos estiveram presentes em torno de 70% dos genótipos suscetíveis em F 5 e em, aproximadamente, 90% dos indivíduos suscetíveis em F 6 . Entretanto, os marcadores EST‐SSR polimórficos entre populações contrastantes para a resistência ao bicho‐mineiro não foram correlacionados às características avaliadas. Os marcadores SSR apresentam polimorfismo inter e intraespecífico em C. arabica e C. racemosa.