CARACTERIZAÇÃO DE MARCADOR DO TIPO EST-SSR ASSOCIADO A RESISTÊNCIA AO BICHO-MINEIRO

Abstract

Um dos fatores que limitam o desenvolvimento de novas cultivares de cafeeiro por Programas de Melhoramento é a dificuldade de seleção precoce para características agronômicas superiores. Atualmente, marcadores moleculares são utilizados, em diferentes espécies de plantas, como uma ferramenta alternativa e eficiente para seleção de tais características. Portanto, a identificação de marcadores moleculares do tipo microsatélite (ssr) que co-segreguem com a resistência ao bicho-mineiro representa um avanço para seleção assistida. Neste estudo, foram identificados marcadores ssr expressos, através de buscas dirigidas aos bancos de ESTs de cafeeiro. Para caracterização dos marcadores EST-SSR, foi avaliada a expressão destes em genótipos resistentes e suscetíveis infestados com bicho-mineiro, através da metodologia de RT-PCR. Dentre os locos EST- SSR investigados um deles apresentou padrão diferencial, uma vez que folhas suscetíveis não apresentaram expressão do loco. O loco foi clonado e sequenciado, a partir de genótipos resistentes e suscetíveis. Análises das sequências permitiram a identificação de 11 alelos, contendo vários polimorfismos de tamanho da repetição e do tipo SNPs. No entanto, nenhum destes polimorfismos apresentou co-relação com a característica de resistência. Análises em andamento visam a caracterização deste loco expresso.

The development of new coffee cultivars has been limited by the difficulty in early selection of desirable agronomic traits. Currently, molecular markers have been used as an alternative and efficient selection tool by breeding programs of several plant species. Therefore, identification of microsatellites markers (ssr) that co-segregate with resistance to leaf-miner represent a significant tool for assisted selection. In this study, expressed ssr markers were identified by directed searches on the Brazilian Coffee ESTs Database. Expression of EST- SSR loci was evaluated in susceptible and resistant genotypes infected with the leaf-miner, through RT-PCR. One of evaluated loci exhibited differential expression pattern in susceptible infected leaves, which did not exhibited the marker amplification. The locus was cloned and sequenced from both susceptible and resistant genotypes. Sequence analyses allowed identification of 11 alleles, with several polymorphisms, including motif repeat size and SNPs. However, none of these polymorphisms are co-related with resistance trait. Analyses aiming the characterization of this expressed locus are underway.