CATEGORIZAÇÃO FUNCIONAL DE SEQUÊNCIAS EXPRESSAS ENVOLVIDAS NA DEFESA DO CAFEEIRO A DOENÇAS

Abstract

O entendimento dos mecanismos de defesa e da interação do cafeeiro com patógenos pode ser útil no desenvolvimento de novas alternativas para um controle eficiente das doenças. Tem sido demonstrado, em diferentes espécies de plantas, que genes R, responsáveis pelo reconhecimento dos patógenos, apresentam domínios conservados, como NBS (Nucleotide Binding Site) e LRR (Leucine Rich Repeat). Dessa forma, nesse trabalho, seqüências do Projeto Brasileiro do Genoma Café, previamente identificadas como contendo domínios NBS e LRR, foram funcionalmente categorizadas. A categorização foi realizada em 140 EST-contigs, sendo que 99 foram classificados em pelo menos uma das categorias funcionais do Gene Ontology. Essa categorização permitiu associar os produtos preditos das EST-Contigs com os processos biológicos que incluíram resposta de defesa e apoptose e com funções moleculares como ligação a nucleotídeo e atividade de transdutor de sinais. Esses e outros termos encontrados são comprovadamente relacionados com a atuação de genes de resistência no mecanismo de defesa da planta.

Understanding defense mechanisms and interaction between coffee and its pathogens may be useful in developing novel alternatives for an efficient control of diseases. It has been verified, in different plant species, that R genes, responsible for pathogens recognition, show conserved domains as NBS (Nucleotide Binding Site) and LRR (Leucine Rich Repeat). In this work, sequences from the Brazilian Coffee Genome Project, previously identified as NBS and LRR-containing domains, have been functionally categorized. Categorization was performed in 140 EST-Contigs, of which 99 were classified in at least one of the Gene Ontology functional categories. This categorization permitted to associate the EST-Contigs predicted products with biological processes including defense response and apoptosis and with molecular functions such as nucleotide binding and signal transducer activity. These and other terms found are proved to be related to the action of disease resistance genes in the plant defense mechanism.