Expressão de fatores de transcrição tipo WRKY no banco genoma funcional de café (Coffea sp.)

Abstract

A expressão de genes relacionados a fatores de transcrição tipo wrky no genoma funcional do café foi avaliada. Foram observadas 227 reads relacionadas com proteínas WRKY no Coffea arabica, 205 reads no Coffea canephora e 10 reads no Coffea racemosa. Dentre as seqüências que apresentaram homologia com proteínas WRKY encontram-se seqüências de proteínas que apresentam o domínio NBS-LRR em sua estrutura assim como proteínas relacionadas a genes de resistência de espécies diferentes. As seqüências obtidas estão relacionadas a diferentes situações fisiológicas em especial desenvolvimento, estresse biótico e abiótico.The expression of wrky transcription factor genes in the coffee functional genome was analyzed. It was found 227 reads related to WRKY proteins in Coffea Arabica, 205 reads in Coffea canephora and 10 reads in Coffea racemosa. Among the homologue protein sequences it was also observed some related proteins which have NBS-LRR domain in their structure or probable resistance proteins from different species. The obtained sequences were correlated to different physiological situations specially related to development, abiotic and biotic estresses.