Uso de marcadores RAPD na avaliação da diversidade genética entre acessos de Coffea

Abstract

A ampliação da diversidade genética é importante para o melhoramento genético do café, fazendo com que informações sobre distâncias genéticas entre acessos de um banco de germoplasma baseadas em marcadores moleculares sejam úteis na identificação desta diversidade. Marcadores RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) foram usados para avaliar as distâncias genéticas entre 40 genótipos de café do banco de germoplasma da Universidade Federal de Viçosa (incluindo quatro espécies diferentes). Foram utilizados 11 primers arbitrários da Operon Technologies, Inc., com repetição. Os produtos amplificados foram separados em geis de agarose 1,4%, tratados com brometo de etídeo e visualizados em um transiluminador UV. A técnica RAPD foi eficiente na identificação de variações entre acessos de Coffea. O agrupamento baseado no estudo com estes marcadores concordou com as relações genéticas previamente conhecidas.

Molecular genetic distance information is helpful, since the enlargement of the genetic diversity is important for arabica coffee tree improvement. RAPD markers (Random Amplified Polymorphic DNA) were used to evaluate genetic distances among 40 coffee genotypes of the Universidade Federal de Viçosa coffee germoplasm (including four different species). A set of 11 arbitrary decamer oligonucleotides (Operon Technologies, Inc.) was used for the PCR amplification of DNA sequences. Amplified DNA fragments were separated by electrophoresis in a 1.4% agarose gel and photographed under UV light after staining with ethidium bromide. RAPD technique was efficient to detect variations among accessions of Coffea. The clustering based on these markers agreed with the known genetic relationship.