Identificação de fatores de transcrição MYB envolvidos em diversos processos celulares de Coffea arabica

Resumo

O Brasil é o maior produtor mundial de café e é dono do segundo maior mercado consumidor. Uma das maiores preocupações dos produtores é a qualidade dos grãos que envolvem processos de florescimento e maturação influenciando na qualidade final do produto. Fatores de transcrição são genes reguladores-chave nos diversos processos biológicos que ocorrem durante o desenvolvimento do cafeeiro. Genes MYB constituem a mais extensa família de fatores de transcrição em plantas e dentre as diversas funções desempenhadas por proteínas MYB estão a regulação do ciclo celular, controle de numerosas rotas biossintéticas mais comumente incluindo produção de antocianinas, flavonóides; proliferação e especificação celular. Baseado no banco de dados CAFEST, identificou-se genes presentes nesta extensa família, sendo realizada análises de filogenia, análise dos motivos de agrupamento vizualisando as regiões conservadas e prováveis locais de expressão espacial e temporal ("Digital Northern Blot"). Desse modo foi possível a identificação de expressão de genes MYB envolvidos em vários processos celulares do cafeeiro.
Brazil is the world’s biggest coffee producer and has the second consumer market. One of the biggest concerns of the producers is the quality of the grains in which involve process of flowering and maturation leading to the final quality of the product. Transcription factors are regulatory genes in the several biological processes and are expressed during the development of the Coffea tree. MYB genes constitute the most extensive family of plant transcription factors and are play important roles in several cellular events such as cellular cycle, control of numerous biosynthetic pathways more usually including production of antocianins, flavonoids; proliferation and cellular specification. Based on the CAFEST database, MYB genes were identified, phylogenetic analyses performed, analysis of the clustering motifs visualizing conserved regions and putative regions of temporal and spatial expression ("Digital Northern Blot"). Thus, it was possible the identification of MYB gene expression involved in some cellular processes of Coffea arabica.

Descrição

Trabalho apresentado no Simpósio de Pesquisa dos Cafés do Brasil (5. : 2007 : Águas de Lindóia, SP). Anais. Brasília, D.F. : Embrapa Café, 2007.

Palavras-chave

Rotas metabólicas Expressão gênica Bioinformática Transcriptoma, Metabolic pathways Gene expression Bioinformatics Transcriptome

Citação

Carneiro, Monalisa H.; Oliveira, Raphael Ricon de; Chalfun Junior, Antonio; Paiva, Luciano Vilela. Identificação de fatores de transcrição MYB envolvidos em diversos processos celulares de Coffea arabica. In: Simpósio de Pesquisa dos Cafés do Brasil (5. : Águas de Lindóia, SP : 2007). Anais. Brasília, D.F. : Embrapa - Café, 2007. (1 CD-ROM), 4p.

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