SPCB - Simpósio de Pesquisa dos Cafés do Brasil

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    Módulo generalizado para reconstrução e visualização 3D de caffeiros com frutos baseado em um banco de dados de Coffea arabica
    (Embrapa Café, 2015) Matsunaga, Fabio Takeshi; Pense, Wagner Luiz; Brancher, Jacques Duílio; Rakocevic, Miroslava
    A arquitetura de cafeeiros arábica (Coffea arabica L.) é descrita pelo modelo de Roux, o que indica a existência de dimorfismo de galhos. As medições de plantas foram realizadas na escala de metâmeros ou pela amostragem (medições mistas). As plantas foram codificadas em grafos em árvores multiescalares (MTG) no software VPlants. O objetivo deste trabalho foi desenvolver um módulo computacional denominado Cafe3D para reconstrução de plantas de cafeeiros, permitindo sua visualização da estrutura topológica (estruturas de ramificações) e geométrica (folhas + frutos) em 3D. Para isso foi desenvolvido um banco de dados de MTG de diversos genótipos e manejo de cafeeiros, de modo que o usuário possa selecioná-los para reconstrução. Software Cafe3D permite a reconstrução e visualização 3D de todos os constituintes de cafeeiros (estrutura de galhos, folhas e frutas), com todos os atributos correspondentes. No Cafe3D, o MTG pode ser obtido do banco de dados ou pode ser algum MTG próprio gerado pelo usuário. Este MTG foi convertido em uma estrutura de dados computacional denominado EDCafe, utilizando os recursos de orientação a objetos e classes em Python. Esta estrutura genérica permitiu que o usuário especifique todos os atributos desejados. Dessa forma, o usuário não necessita ter conhecimento da estrutura semântica de um MTG, basta apenas ter conhecimento das informações topológicas e geométricas, como estruturas de ramificações e valores dos atributos foliares e de frutos, significando que com um mínimo de informações, cada usuário pode produzir as suas maquetes de cafeeiros em 3D.
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    AmostraCafe3D – Software para inclusão de informações na escala de metâmeros em eixos plagiotrópicos parcialmente codificados
    (Embrapa Café, 2013) Rakocevic, Miroslava; Tosti, Jonas Barbosa; Matsunaga, Fabio Takeshi
    Café arábica (Coffea arabica L.) tem o crescimento contínuo; a sua arquitetura segue o modelo de Roux que é definido pela diferenciação geométrica e funcional entre o tronco principal – ortotrópico e os eixos laterais – plagiotrópicos. As medições de arquitetura de cafeeiros estão sendo feitas através de amostragem. O eixo principal é sempre descrito na escala de metâmeros, enquanto se amostram quatro eixos plagiotrópicos de 2ª ordem de ramificação (orientados para quatro pontos cardeais) em cada estrato do perfil vertical, a cada 40 cm. Nesses eixos realiza-se codificação completa na escala de metâmeros, mais a descrição detalhada das suas ramificações laterais de 3ª a 5ª ordem. Todos os outros ramos plagiotrópicos de 2ª ordem foram descritos pela sua posição ao longo de eixo ortotrópico, seu comprimento total, numero de frutos e orientação cardinal. O objetivo deste trabalho foi desenvolver um software (AmostraCafe3D) auxiliar a VPlants, para inclusão de informações na escala de metâmeros em eixos parcialmente codificados, considerando interpolação, proporcionalidade e probabilidade de ocorrência de eventos botânicos. Plantas foram codificadas em objetos matemáticos hierarquizados que apresentam topologia e geometria de plantas (MTG). As saídas do software são MTGs de entrada enriquecidos com as informações incluídas após a computação. AmostraCafe3D considera duas situações: 1) não houve nenhuma observação temporal precedente e 2) existiram observações precedentes dos mesmos indivíduos. A lógica de inclusão de informações em eixos parcialmente medidos é baseada nos eixos completamente medidos do estrato e da orientação procurada em todas as plantas. O comprimento de cada entrenó é estimado como média referente ao seu índice. A probabilidade de presença de folhas e ramificações em cada metâmero é baseada na ocorrência deste evento em eixos medidos e distribuída em eixos reconstruídos com algoritmo randômico. A distribuição de frutos ajustou-se através da interpolação linear e a de Lagrange. A validação do modelo desenvolvido deu-se por comparação de área foliar formada pelos estratos de perfil vertical de cafeeiros completamente codificados de cv. IAPAR 59 com as maquetes geradas pelo AmostraCafe3D. Atualmente, o software produz as reconstruções com uma fraca superestimação de área foliar, melhor estimada em camadas de 40 cm do que em plantas inteiras.