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Item In vitro pollination and fluorescence microscopy for characterization of gametophytic selfincompatibility of Coffea canephora Pierre ex A. Froehner(Crop Breeding and Applied Biotechnology, 2021-11-20) Souza, Carolina Augusto de; Rocha, Rodrigo Barros; Santos, Maurício Reginaldo Alves dos; Lopes, Tatiane Almeida; Teixeira, Alexsandro Lara; Espindula, Marcelo CuritibaThe objectives of this study were to optimize in vitro pollination and fluorescence microscopy procedures to characterize the gametophytic selfincompatibility of Coffea canephora genotypes. For that purpose, 115 in vitro pollinations were carried out among 30 parent plants of the Conilon (17) and Robusta (13) botanical varieties. Tester plants of compatibility groups I, II, and III were used as pollen grain donors. On the day of anthesis, pollen grains of the donor genotypes were transferred in vitro to one of the sides of the bifid stigma of each receptor flower. After 30 hours, the development of the pollen tubes was evaluated in fluorescence microscopy. Eleven genotypes (37%) were classified in compatibility Group I, thirteen (43%) in Group II, and six (20%) in Group III. In vitro pollination allowed reduction in the time necessary to diagnose compatibility, without exhibiting contamination caused by the presence of pollen grains of non-donor plants.Item Coffea canephora breeding: estimated and achieved gains from selection in the Western Amazon, Brazil(Universidade Federal de Santa Maria, 2021) Rocha, Rodrigo Barros; Teixeira, Alexsandro Lara; Ramalho, Andre Rostand; Espindula, Marcelo Curitiba; Lunz, Aureny Maria Pereira; Souza, Flavio de FrançaGain from selection is an important criterion in quantifying the efficiency of breeding programs. This study quantified the selection gain estimated under experimental conditions and realized gain achieved in the field, seeking to interpret the efficiency of the Coffea canephora selection. For that purpose, we considered experiments that began in 2004 with directed hybridizations to obtain new hybrid progenies. From a breeding population composed of 288 hybrid individuals, 12 genotypes were selected in experimental conditions from 2005 to 2012, with amplitude in the estimated gains from 127.70 to−19.19%. Those genotypes were evaluated from 2012 to 2018 in clonal tests in four environments of the Western Amazon. The environment that exhibited the greatest correlation between the predicted genetic values and the realized genetic gain observed in the field was the environment of Ouro Preto do Oeste, RO (0.67), the location in which the plants were selected, followed by the environments of Alta FlorestaD´Oeste, RO (0.44), Rio Branco, AC (0.43), and Porto Velho, RO (0.37). Experimental conditions showed that the effect due to dominance deviations was approximately three times greater than the additive effect. Nine clones exhibited higher genetic gains in the experimental conditions and at field, and two clones exhibited lower estimated gains and lower field performance.The clone G17-P7 exhibited high genetic gain under experimental conditions and low field performance. The selection in experimental conditions was positively correlated with plant performance in the field (r=0.55), which allows reduction of the original breeding population to a set of more promising clones to be grown in multiple environments, optimizing time and resources.Item Beverage quality of Coffea canephora genotypes in the western Amazon, Brazil(Editora da Universidade Estadual de Maringá - EDUEM, 2021) Morais, Johnnescley Anes de; Rocha, Rodrigo Barros; Alves, Enrique Anastácio; Espindula, Marcelo Curitiba; Teixeira, Alexsandro Lara; Souza, Carolina Augusto deThis study aimed to evaluate the beverage quality of Coffea canephora genotypes in different environments of the western Amazon to assist plant selection and new cultivar development. To analyze beverage quality, samples of cherry coffee beans were collected separately for each genotype from clonal competition trials installed in the municipalities of Ouro Preto do Oeste, Alta Floresta do Oeste, Porto Velho, and Ariquemes in Rondônia State and Rio Branco in Acre State (Brazil). The beverage quality was assessed using the Robusta Cupping Protocol, which attribute to each genotype a score in a range from 0 to 100, highlighting nuances. Analysis of variance and principal components using reference points were used to quantify genotype x environment interaction (G x E). The analysis of variance indicated that genotypic and G x E interaction effects were significant (p < 0.01). By using a centroid dispersion method, we could identify four clones of low, eight of specific (to favorable or unfavorable environments), and seven of broad adaptability to the environments. The clones BRS 2314, 11, and 17 had average quality scores above 80 in all environments, with potential for specialty coffee production. The clones BRS 1216, BRS 3220, and BRS 3193 presented unstable behavior, with beans of higher quality in some of the evaluated environments. Such inconsistency in clone behavior is caused by unpredictable changes in plant performance in different environments. Our results indicate that both genotypic (clones) and G x E interaction effects are important for the expression of coffee beverage quality. However, the clones BRS 3213, BRS 3210, and BRS 2299 had less prominent nuances, with lower potential for specialty coffee production.Item Caracterização da autoincompatibilidade gametofítica de acessos de banco ativo de germoplasma de Coffea canephora(Embrapa Café, 2019-10) Souza, Carolina Augusto de; Vieira Júnior, José Roberto; Santos, Maurício Reginaldo Alves dos; Teixeira, Alexsandro Lara; Ramalho, André Rostand; Espindula, Marcelo Curitiba; Ferrão, Maria Amélia Gava; Rocha, Rodrigo BarrosO Coffea canephora é uma espécie alógama que apresenta autoincompatibilidade gametofítica (AIG), de expressão governada por um único gene multialélico, identificado pela letra S. Na cafeicultura clonal o plantio de clones não compatíveis pode reduzir a produtividade e a qualidade dos grãos devido a menor eficiência da polinização e aumento na taxa de grãos do tipo moca. O objetivo desse trabalho é caracterizar a autoincompatibilidade de acessos do Banco de Germoplasma da Embrapa quantificando a diversidade alélica e genotípica de uma população de melhoramento, fornecendo subsídios para manipulação dessa característica no desenvolvimento de novas variedades. Para isso foram realizadas hibridações in vitro entre 28 genótipos de um campo de hibridação contendo 80 matrizes das variedades botânicas Conilon e Robusta. Os procedimentos de hibridação in vitro se iniciaram um dia antes da antese, com a proteção dos ramos doadores utilizando sacos de papel do tipo kraft de 55x25cm e transferência dos estigmas das plantas receptora para meio de cultura (sacarose 10%). Os genótipos doadores de grãos de pólen BRS 1216, BRS 2299 e BRS 3193 foram utilizados como plantas testadoras dos grupos de compatibilidade I, II e III respectivamente. A polinização in vitro foi realizada no dia da antese com a raspagem dos grãos de pólen que é colocado em contato com apenas um dos dois estigmas de cada pistilo bífido. A compatibilidade das hibridações foi avaliada utilizando coloração com azul de anilina a 1% para visualização do desenvolvimento dos tubos polínicos utilizando microscopia de fluorescência. A eficiência de polinização foi estimada pela relação entre o número de estigmas fertilizados e o número total de estigmas polinizados. A utilização de plantas testadoras dos grupos de compatibilidade permitiu reduzir o número de hibridações necessárias para caracterizar os genótipos das plantas. A polinização in vitro resultou em uma taxa média de pegamento de 60,3% com amplitude de 11 a 85% de pegamento nas hibridações compatíveis. Entre os 28 clones caracterizados 17 genótipos (61%) foram incompatíveis com a planta testadora do grupo I, 5 clones (18%) apresentaram incompatibilidade com a planta testadora do grupo II e 6 clones (21%) foram incompatíveis com o testador do grupo III. Os resultados parciais da caracterização dessa população de melhoramento indicam a distribuição dos genótipos em três grupos de compatibilidade com as frequências dos alelos S 1 , S 2 e S 3 , estimadas em 0,39, 0,41 e 0,20 respectivamente. Apesar da diferença observada entre as frequências alélicas, as frequências genotípicas não diferem das proporções esperadas para uma população em Equilíbrio de Hardy Weinberg (EHW), com 1% de probabilidade. A caracterização do genótipo do gene S é importante, impactando na eficiência de polinização desse cultivo, com o favorecimento natural de cruzamentos compatíveis.Item Characterization of beverage quality in Coffea canephora Pierre ex A. Froehner(Editora UFLA, 2018-04) Souza, Carolina Augusto de; Rocha, Rodrigo Barros; Alves, Enrique Anastácio; Teixeira, Alexsandro Lara; Dalazen, Janderson Rodrigues; Fonseca, Aymbiré Francisco Almeida daDifferentiation of coffee according to its quality can result in added value. Both the coffee genotype and the environment influence beverage quality. The main species grown in the Amazon region is C. canephora, which includes two distinct botanical varieties: Conilon and Robusta. The aim of this study was to characterize beverage quality in C. canephora and distinguish the Conilon and Robusta botanical varieties and intervarietal hybrids. We evaluated the beverage quality of 130 superior clones from samples of hulled coffee collected in the experimental field of Embrapa Rondônia in the municipality of Ouro Preto do Oeste, RO, Brazil. The beverage was classified according to the Robusta Cupping Protocols, which also considers the nuances of the beverage, described as neutral, fruit-like, exotic, refined, and mild. The final mean values classified the Robusta botanical variety and the intervarietal hybrids as coffees with a premium beverage, and the Conilon botanical variety as usual good quality. The nuances of the Conilon botanical variety were found to be predominantly neutral (78%), as compared to the Robusta botanical variety and the intervarietal hybrids, which exhibited 50% and 44% of their beverages, respectively, with fruit-like, exotic, or mild nuances. The genetic parameters indicate that the genetic component was more important than the environmental in expression of coffee quality attributes. Genetic variability was observed in the population evaluated, except for the Uniform Cup and Clean Cup beverage attributes.Item Different volumes of tubes for clonal propagation of Coffea canephora from seedlings(Editora UFLA, 2018-01) Espindula, Marcelo Curitiba; Balbino, Tony José; Jaraceski, Rutinéia; Teixeira, Alexsandro Lara; Dias, Jairo Rafael Machado; Teixeira, Richelly Gisela PasqualottoThe aim in the present study was to evaluate the growth of Coffea canephora cv. ‘Conilon BRS Ouro Preto’ seedlings in different tube volumes. The experiment was performed at Embrapa Rondônia plant nursery in Ouro Preto do Oeste, Rondônia, Brazil, from July to November 2013. The treatments consisted of five tube volumes (50, 100, 170, 280 and 400 cm 3) plus one control composed by polyethylene bags (11 cm width x 20 cm height) with capacity of 770 cm 3 . The experimental design was a randomized complete block design with 15 replicates, formed by 15 clones that compose the Conilon ‘BRS Ouro Preto’ cultivar. The tube volume of 280 cm 3 provide the best vegetative performance of seedlings, similarly to volume of 400 cm 3 , thus, the use of larger tubes would not justify. Tubes of 50, 100 and 170 cm 3 produce seedlings with physiological quality similar to the control until 130 days after staking, but may limit the development of seedlings in a longer period.Item Caracterização e uso da variabilidade genética de banco ativo de germoplasma de Coffea canephora Pierre ex Froehner(Editora UFLA, 2013-10) Rocha, Rodrigo Barros; Vieira, Diogo dos Santos; Ramalho, André Rostand; Teixeira, Alexsandro LaraEstratégias eficientes para manipular a variabilidade genética são determinantes para o sucesso dos programas de melhoramento de Coffea canephora. Combinações entre genitores divergentes expressam maior efeito heterótico, devendo a seleção de matrizes considerar, simultaneamente, a divergência genética e o desempenho agronômico superior.Objetivou-se, neste trabalho, quantificar a diversidade genética de acessos de C. canephora do Banco Ativo de Germoplasma da Embrapa Rondônia, visando à identificação de plantas de maior divergência genética e maior potencial produtivo para hibridização. Para isso, entre 1100 acessos foram pré-selecionadas 89 plantas para avaliação dos principais componentes da produção de café beneficiado. Para a quantificação da diversidade genética foi utilizada a técnica de componentes principais, associada a pontos de referência para reunir as informações de divergência genética e de desempenho agrícola em uma única análise. Os acessos selecionados apresentaram expressiva variabilidade genética para os principais componentes de produção, com destaque para os valores de peneira média acima de 17, o que indica uma condição favorável para a realização de cruzamentos controlados visando à seleção de plantas de maior produtividade e tamanho de grãos.