Biblioteca do Café
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Item Sequenciamento e análise da variabilidade genética de vírus transmitidos por ácaros do gênero Brevipalpus no Brasil(Escola Superior de Agricultura “Luiz de Queiroz” - Universidade de São Paulo, 2016) Jesus, Camila Chabi de; Freitas-Astúa, Juliana deAcredita-se que o Brasil é o centro de diversidade de vírus transmitidos por ácaros do gênero Brevipalpus (VTB). Alguns desses VTB infectam culturas fundamentais para o agronegócio brasileiro como citros e café, além de maracujá e de várias plantas ornamentais. Na última década os genomas de dois deles, Citrus leprosis virus C (CiLV-C) e Coffee ringspot virus (CoRSV) foram sequenciados, mas ainda é escasso o conhecimento sobre a diversidade genética e processos evolutivos envolvidos na população dessas espécies. Neste contexto, o objetivo deste trabalho foi caracterizar molecularmente novas estirpes de CiLV-C e CoRSV que infectam citros e café, respectivamente. E revelar as relações filogenéticas com espécies de VTB conhecidas, assim como avaliar a variabilidade genética da população de CiLV- C no Brasil. Para o estudo de CiLV-C, 47 amostras de Citrus sinensis apresentando sintomas típicos da leprose dos citros foram coletadas em diferentes regiões do Brasil no período de 2011-2015. A presença de CiLV-C foi detectada por RT-PCR em todas as amostras coletadas e, posteriormente, foi realizado o sequenciamento de quatro regiões do genoma viral (p29, p15, RI e MP) de cada isolado. As sequências obtidas foram utilizadas no estudo de filogenia e variabilidade da população de CiLV-C no Brasil. Foi demonstrado que a população de CiLV-C apresenta uma variabilidade relativamente baixa; entretanto, foi identificada a existência de duas linhagens dentro da espécie, nomeadas Cor e SJRP. Os genomas completos de CiLV-C SJRP e também do dicorhavirus tentativo CoRSV identificado em Limeira, SP, foram obtidos mediante o sequenciamento de RNA de pequeno tamanho (siRNA). Cada sequência foi validada mediante o sequenciamento de fragmentos gerados por RT-PCR ao longo do genoma. CiLV-C SJRP apresenta cerca de 85% de identidade de nucleotídeo com o membro-tipo do gênero Cilevirus e exibe evidências de recombinação com isolados da linhagem Cor, a prevalente no território brasileiro. Globalmente, o genoma de CoRSV Limeira apresenta mais de 90% de identidade de nucleotídeo com isolado CoRSV Lavras, o que indica que ambos os isolados são membros da mesma espécie tentativa de dichorhavirus.Item Influência de cobertura vegetal do solo e da precipitação pluvial na população de ácaros-praga e de ácaros predadores em cafeeiros orgânico e convencional(Universidade Federal de Lavras, 2009-03-05) Pedro Neto, Marçal; Reis, Paulo RebellesOs ácaros-praga Brevipalpus phoenicis (Geijskes, 1939) e o Oligonychus ilicis (McGregor, 1917) (Acari: Tenuuipalpidae, Tetranychidae) são responsáveis por perdas significativas na produção de café, e afetando a qualidade da bebida tanto na produção convencional como na orgânica. Na cafeicultura conduzida no sistema convencional, os ácaros são controlados quando necessário com acaricidas e inseticidas acaricidas e no orgânico, o controle é realizado naturalmente pelos ácaros predadores, principalmente aqueles pertencentes à família Phytoseiidae comumente encontrados em lavouras cafeeiras. Há a necessidade do uso de estratégias que favoreçam a conservação e aumento do número de ácaros predadores no agroecossistema cafeeiro. Dessa forma, os objetivos do presente trabalho foram estudar a influência de cobertura vegetal do solo na população de ácaros-praga do cafeeiro e seus inimigos naturais; influência da precipitação pluvial no número e distribuição de ácaros em dois anos e a comparação do número de ácaros em dois sistemas de produção de café, orgânico e convencional. Os experimentos foram conduzidos nas Fazendas Cachoeira e Taquaril no município de Santo Antônio do Amparo, MG. A análise das amostras e identificações dos ácaros foram realizadas no laboratório de Acarologia da EPAMIG, em Lavras, MG. Conclui-se que: algumas plantas adventícias encontradas nas entre linhas de cafeeiros são hospedeiras do ácaro vetor do vírus da mancha-anular do cafeeiro, B. phoenicis, e hospedam também os predadores da família Phytoseiidae Euseius compositus Denmark e Muma, 1970, Euseius concordis (Chant, 1959) e Euseuis citrifolus Denmark e Muma 1973, entre outros, sendo importante o manejo dessas plantas nas entre linhas dos cafeeiros proporcionando abrigo e alimento aos ácaros predadores que podem se transferir para os cafeeiros. A precipitação pluviométrica influencia nas densidades dos ácaros-praga e predadores nos diferentes sistemas de produção de café, com menor intensidade no café produzido no sistema orgânico. O sistema de produção de café convencional apresentou maiores médias de ácaros-praga em relação ao orgânico. A espécie de ácaro predador mais observada foi o E. concordis, independente do sistema de cultivo.