Trabalhos de Evento Científico
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Resultados da Pesquisa
Item Determinação de marcador molecular associado à resistência a Meloidogyne paranaensis em Coffea arabica L.(Embrapa Café, 2015) Macedo, Camila Ronchi; Ruas, Claudete de Fátima; Fernandes, Thiago; Gaino, Ana Paulo Silva Campos; Ruas, Eduardo Augusto; Machado, Andressa Cristina Zambolim; Sera, Tumoru; Sera, Gustavo Hiroshi; Ruas, Paulo MaurícioMeloidogyne paranaensis é um agente patogênico que desestabiliza a cultura de Coffea arabica L. A resistência genética é uma das principais alternativas de controle, porém é rara em plantas de C. arabica, mas alta em C. canephora e C. liberica. Recentemente foi lançada no mercado a cultivar IPR100, que apresenta resistência a M. paranaensis. Este trabalho teve por objetivo identificar e isolar marcadores moleculares associados à resistência a M. paranaensis. Foram utilizadas plantas F2 resultantes do cruzamento entre IAPAR 59 x G37 (resistente). Utilizou-se bulks de plantas resistentes e suscetíveis da geração F2, os quais foram submetidos a 299 combinações de primers AFLP. Sete locos AFLP sugeriram associação com a resistência ao nematoide, porém destes, somente o loco 4 (EcoRI AGG/MseI CTT) mostrou estar associado a resistência a M. paranaensis. Este loco foi transformado no marcador SCAR Ca_Nem1, o qual foi validado em IPR 100 e IAPAR 59, sendo que o mesmo amplificou em 95% das plantas resistentes. Através de análises in silico demonstrou-se que a sequência do SCAR Ca_Nem1 tem alta similaridade com o fator de transcrição MYB46 e o gene de resistência RGA1. Os dados deste trabalho mostram que o marcador SCAR Ca_Nem1 tem potencial para a seleção assistida de novos cultivares de C. arabica resistentes a M. paranaensis.Item Variabilidade genética em cultivares do ensaio nacional de Coffea arabica L.(Embrapa Café, 2015) Macedo, Camila Ronchi; Chaves, Camila Lucas; Góes, Bruna Delgado; Ruas, Eduardo Augusto; Bejatto, Nataiane Cristina; Lopes, Patrícia Juliana; Matias, Otavio Pollo; Rodrigues, Kaique Marques; Souza, Natalia Luiz de; Ruas, Claudete de Fátima; Sera, Tumoru; Sera, Gustavo Hiroshi; Ruas, Paulo MaurícioOs programas de pesquisa e melhoramento de Coffea arabica L. resultaram na obtenção de cultivares com expressivas produtividades e adaptadas às diversas regiões produtoras, classificando o Brasil como maior produtor e exportador no cenário mundial. Um dos grandes desafios para os programas de melhoramento genético é superar a produtividade das melhores cultivares. A avaliação da variabilidade genética é crucial para futuros planejamentos nesses programas. O objetivo desse trabalho foi verificar a variabilidade genética entre e dentro de cultivares do Ensaio Nacional de Café pela técnica de AFLP. Foi detectada uma variação na porcentagem de locos polimórficos de 23,90% a 69,47%, e a diversidade gênica de Nei (Hs) variou de 0, 064 a 0, 199. A média da distância genética de Huff variou de 7,61 ±3,1 a 13,46 ±4,7. AMOVA revelou uma variância de 79,04% dentro e 20,96% entre cultivares. O FST par-a-par evidenciou distâncias genéticas de 0,007 a 0,491 entre cultivares. A AMOVA entre cultivares lançados em diferentes épocas mostrou um aumento da variabilidade genética na década de 1990, com uma pequena redução a partir de 2000. E AMOVA entre diferentes centros de pesquisa mostrou uma variabilidade genética maior (93,93%) para as cultivares do IAPAR. O dendograma mostrou a existência de três grupos, sendo o mesmo confirmado pela coordenada principal e análise bayesiana. Todas essas análises mostram que as 32 cultivares apresenta diferenças da variabilidade genética tanto dentro como entre, sendo que esses dados poderão ser utilizados em futuros programas de melhoramento genético.Item Diferenças genéticas entre seleções de café (Coffea arabica L.) da mesma origem avaliadas por RAPD com digestão prévia com enzima de restrição(2001) Ruas, Paulo Maurício; Sera, Tumoru; Ruas, Claudete de Fátima; Diniz, L. C.; Torres, F. M.; Carvalho, Valdemar de Paula; Rampim, Leandro; Ruas, Eduardo Augusto; Silveira, S. R.; Consórcio Brasileiro de Pesquisa e Desenvolvimento do CaféMarcadores moleculares RAPD, obtidos após digestão do DNA genômico com enzimas de restrição, foram utilizados para análise da distância genética em 14 variedades de Coffea arabica. Vinte e quatro primers RAPD amplificaram um total de 330 fragmentos dos quais 224 (68%) foram polimórficos. Os produtos de amplificação foram analisados pelo método de agrupamentos UPGMA, construído a partir de uma matriz de distância genética. A cultivar Mundo Novo foi a que apresentou maior distância genética (variando de 0,27 to 0,43) e pode portanto ser utilizada em cruzamentos que devem resultar em híbridos com maior performance. Os resultados sugerem a possível origem da cultivar Kattimor. Algumas das associações observadas na análise dos grupos mostram que as cultivares Caturra Vermelho e Caturra Amarelo mostraram uma distância genética de 0,18 e, dentre as linhagens irmãs do IAPAR-59, a cultivar ‘IAPAR-75163-12’ é a mais distinta. Além disso, os marcadores RAPD mostram que o F-2 derivado do cruzamento ‘IAPAR-59’ X ‘Mundo Novo’ apresenta uma distância genética de 0,16 e 0,41 em relação aos dois cultivares, respectivamente. Os resultados mostram que marcadores RAPD, obtidos após a digestão do DNA genômico com enzimas de restrição, são eficientes para a caracterização genética de genótipos C. arabica além de fornecer informação importante sobre a provável origem do cultivar Kattimor.Item Diferenciação genética interspecífica e análise de pedigree em Coffea identificada com marcadores ISSR (Inter simple sequence repeats)(2001) Rampim, Leandro; Ruas, Paulo Maurício; Ruas, Claudete de Fátima; Carvalho, Valdemar de Paula; Sera, Tumoru; Silveira, S. R.; Torres, F. M.; Consórcio Brasileiro de Pesquisa e Desenvolvimento do CaféMarcadores moleculares contidos entre seqüências curtas de DNA repetitivo (ISSRs) foram utilizados para análise da distância genética entre espécies e para determinação da origem de sete híbridos interespecíficos de Coffea. Um total de 14 primers, contendo diferentes seqüências simples repetidas (SSR) de DNA, foram combinados dois a dois e usados para amplificação em reações de PCR. As combinações contendo o primer (GA)9+T produziram maior número de marcadores e maior polimorfismo, sugerindo maior freqüência desta classe de dinucleotídio nos genomas de Coffea. Cento e setenta marcadores foram obtidos. Os produtos de amplificação foram analisados pelo método de agrupamentos UPGMA, construído a partir de uma matriz de distância genética. A variação genética interespecífica foi alta, com os valores de distância genética variando de 0,15 entre C. eugenioides e C. kapakata e 0,66 entre C. congensis e C. liberica var. dewevrei. A espécie C. arabica apresentou vários marcadores considerados como diagnósticos, sugerindo que esta espécie é um dos progenitores de cinco dos seis híbridos analisados. Os resultados mostram que marcadores ISSR são úteis para diferenciar espécies e para determinar a paternidade de híbridos interespecíficos de Coffea.Item Identificação de marcador molecular ligado ao porte de planta em C. arabica(2000) Ruas, Paulo Maurício; Ruas, Claudete de Fátima; Azevedo, Lucas B. de; Carvalho, Valdemar de Paula; Ruas, Eduardo Augusto; Sera, Tumoru; Consórcio Brasileiro de Pesquisa e Desenvolvimento do CaféA metodologia de RAPD foi utilizada para identificação de marcador molecular, relacionado com a característica porte da planta em C. arabica. DNA de dez plantas de porte alto e dez de porte baixo, obtidas de uma geração F2, foram extraídos e, após quantificação, reunidos em "bulk". Os bulks de DNA de plantas de porte baixo e porte alto foram utilizados para amplificação com 120 primers de RAPD. Três primers que sugeriram a presença de marcador específico para porte das plantas foram amplificados com DNA das dez plantas de porte baixo e dez plantas de porte alto, individualmente. Um dos marcadores com aproximadamente 1.2 kb, sugeridos nos bulks foi confirmado, ocorrendo em todas as plantas que apresentavam porte baixo. Nenhuma das plantas de porte alto apresentou este marcador, sugerindo fortemente uma associação com a característica em questão. Em continuidade ao projeto este marcador será clonado e sequenciado para verificar sua relação com a característica porte da planta. Após o sequenciamento, as 24 bases do início e do final do fragmento serão utilizadas para construção de dois primers de PCR específicos (SCAR) que serão utilizados para seleção assistida de plantas de porte baixo.Item O uso de RAPD associado a enzimas de restrição para detectar variabilidade genética no banco de germoplasma de Coffea arabica L. do IAPAR(2000) Diniz, Leandro Eugenio Cardamone; Ruas, Paulo Maurício; Ruas, Claudete de Fátima; Sera, Tumoru; Consórcio Brasileiro de Pesquisa e Desenvolvimento do CaféA variabilidade genética existente entre 40 acessos de Coffea arabica foi avaliada utilizando RAPD associado a uma pré-digestão do DNA genômico com endonucleases de restrição. Os acessos analisados fazem parte da coleção de Coffea mantida no Instituto Agronômico do Paraná (IAPAR). A variabilidade genética e a relação entre os acessos foram analisadas utilizando 184 primers. Entretanto, nenhum polimorfismo ou baixo nível de bandas polimórficas foi observada em cada primer. Para melhorar a eficiência na detecção do polimorfismo, o DNA genômico de todos os acessos foi submetido à digestão com enzimas de restrição antes da amplificação. Treze primers utilizados associados ou não às enzimas de restrição, que sugeriram polimorfismo, foram selecionados. Um dendrograma foi construído utilizando o agrupamento UPGMA. Um total de 236 produtos de amplificação foi obtido, com 216 bandas polimórficas (91,5%). Os resultados mostraram a utilidade das enzimas de restrição para estimar a relação genética dos acessos de C. arabica.